Stefan Simić u nogometne je vode zagazio sa šest godina. Rođen je u Pragu, te je njegov izbor bila Slavia. Već sa 15 godina i 11 mjeseci potpisao je sa Slavijom profesionalni ugovor. Zanimljivo je da je debi za prvu momčad Slavije ubilježio na Poljudu. Bilo je to u veljači 2011. kada je praški klub gostovao na Poljudu prilikom proslave rođendana Hajduka. Simić je u igru ušao u 88. minuti. No, službeni nastup za Slaviju nije ubilježio jer je u siječnju 2012. napustio Prag.
Otišao je u Genou koja je za njegove usluge platila 500.000 eura. U Genoi je igrao za Primaveru, a tu je proveo godinu i pol dana. Krajem kolovoza 2013. stigao je u Milan za 120.000 eura. Igrao je za Primaveru 'rossonera', a onda je u sezoni 2014/15 prvi put okusio čari seniorskog nogometa. Milan ga je poslao na posudbu u Varese gdje je ubilježio 17 nastupa u Serie B.
Zbog loma fibule propustio je prvi dio sezone 2015/16, a u siječnju 2016. bio je na korak do prelaska u Hajduk. Sve je bilo dogovoreno, Simić je trebao stići na posudbu, no ozlijedio se Philippe Mexes te ga je tadašnji trener Siniša Mihajlović nazvao da se vrati u Milan zbog manjka stopera. Do kraja sezone često je bio na klupi Milana, no u igru nije ulazio.
U ljeto 2016. uslijedio je novi odlazak na posudbu. Ovaj put izbor je bila Belgija i Excelsior Mouscron. Tu je Simić odigrao 32 utakmice u sezoni, a postigao je i dva pogotka. Uslijedio je povratak u Milan, a zatim krajem kolovoza 2017. odlazak na novu posudbu. U svoje ga je redove doveo Crotone, a te je sezone odigrao deset utakmica. Devet je puta nastupio u Serie A, a jednom u utakmici Kupa. Ukupno je na terenu proveo 641 minutu. Prvi dio prošle sezone odigrao je nekoliko utakmica za Primaveru, a ubilježio je i službeni debi za Milan. U susretu Europske lige odigrao je 90 minuta protiv Dudelangea.
Na zimu je uslijedio odlazak na novu posudbu, ovaj put u Frosinone. No, tu se nije naigrao. U startu je imao problema s ozljedama, a do kraja sezone susrete je odgledao s klupe. Simić je 24-godišnjak, a prošao je sve selekcije Češke. Ima čak i jedan nastup za seniorsku reprezentaciju. Bilo je to u studenom 2017. u prijateljskom susretu protiv Katara.
