Jak vjetar stvara poteškoće i u pomorskom prometu.
U prekidu su trajektne linije Prizna-Žigljen, Zadar (Gaženica)-Ist-Olib-Silba-Premuda-Mali Lošinj, Sumartin-Makarska, Ploče-Trpanj.
Ne prometuju katamaranske linije: Pula-Zadar-Pula, Mali Lošinj-Cres-Rijeka, Novalja-Rab-Rijeka, Zadar-Premuda-Silba-Olib, Šibenik-Kaprije-Žirje, Split-Hvar-Vela Luka-Ubli, Split-Bol-Jelsa, Korčula-Hvar-Split, Split-Vis, Ubli-Korčula-Dubrovnik i Milna-Rogač-Split. I prekidu je i brodska linija Mali Lošinj-Susak-Unije.